Santa Cruz do Arari är en kommun i Brasilien. Den ligger i delstaten Pará, i den nordöstra delen av landet, 1,700 km norr om huvudstaden Brasília. Antalet invånare är 8,163. Santa Cruz do Arari ligger på ön Ilha de Marajó.
Omgivningarna runt Santa Cruz do Arari är huvudsakligen savann. Runt Santa Cruz do Arari är det mycket glesbefolkat, med 5 invånare per kvadratkilometer. Savannklimat råder i trakten. Årsmedeltemperaturen i trakten är 24 °C. Den varmaste månaden är oktober, då medeltemperaturen är 28 °C, och den kallaste är februari, med 22 °C. Genomsnittlig årsnederbörd är 3,077 millimeter. Den regnigaste månaden är mars, med i genomsnitt 580 mm nederbörd, och den torraste är oktober, med 25 mm nederbörd.
